GRUPO DE INVESTIGACÓN BIOINFORMÁTICA Y GENÓMICA FUNCIONAL

Dr. Javier De Las Rivas

Carlos Prieto, Alberto Risueno, Celia Fontanillo

http://www.cicancer.org/lab19a

El Grupo de Investigación en Bioinformática y Genómica Funcional del Centro de Investigación del Cáncer desarrolla trabajos de investigación en bioinformática y biología computacional con especial interés en estudios sobre redes transcriptómicas de coexpresión y redes de interacción de proteínas (PPI), con el objetivo de integrar y analizar sistemas biológicos complejos derivados de las técnicas experimentales "omicas". En todo este trabajo, ponen especial atención hacia sistemas biológicos implicados en cáncer y en procesos metastásicos.

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A continuación se citan algunos algoritmos y herramientas bioinformáticas que ha desarrollado nuestro grupo de investigación, incluyendo links a las web correspondientes donde se explican adecuadamente.

alteredExpression - Algorithm to find deregulated genes

URL: http://bioinfow.dep.usal.es/AlteredExpression

APID - Agile Protein Interaction DataAnalyzer

URL: http://bioinfow.dep.usal.es/apid

mapCGHetExpression - Tool to map CGH and expression changes

URL: http://cicblade.dep.usal.es

MicroarrayDB - Microarrays Database

URL: http://bioinfo.dep.usal.es/MicroarrayDB

ProbeExplorer - Genome and oligo-probe browser

URL: http://probeexplorer.cicancer.org

webbioc - BioConductor Web Tool

URL: http://cicblade.dep.usal.es

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PUBLICATIONS

Scientific Publications: ncbi PubMed

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Other WEB SITES of interest in Functional Genomics

BioConductor: http://www.bioconductor.org

R Project for Statistical Computing: http://www.r-project.org

ENSEMBL Genome Browser: http://www.ensembl.org